diff --git a/Makefile.dep b/Makefile.dep
index dcc82a2b86..1eccad6169 100644
--- a/Makefile.dep
+++ b/Makefile.dep
@@ -680,6 +680,7 @@ ifneq (,$(filter arduino_pwm,$(FEATURES_USED)))
 endif
 
 ifneq (,$(filter xtimer,$(USEMODULE)))
+  DEFAULT_MODULE += auto_init_xtimer
   FEATURES_REQUIRED += periph_timer
   USEMODULE += div
 endif
diff --git a/sys/auto_init/auto_init.c b/sys/auto_init/auto_init.c
index 35f37d222c..4684d97a4b 100644
--- a/sys/auto_init/auto_init.c
+++ b/sys/auto_init/auto_init.c
@@ -24,7 +24,7 @@
 #include "diskio.h"
 #endif
 
-#ifdef MODULE_XTIMER
+#ifdef MODULE_AUTO_INIT_XTIMER
 #include "xtimer.h"
 #endif
 
@@ -111,7 +111,7 @@ void auto_init(void)
     void auto_init_random(void);
     auto_init_random();
 #endif
-#ifdef MODULE_XTIMER
+#ifdef MODULE_AUTO_INIT_XTIMER
     DEBUG("Auto init xtimer module.\n");
     xtimer_init();
 #endif